Трудовую деятельность Евгений Глотов начал в ОЮЛ «Конгресс молодежи Казахстана». В разные годы работал в ОО «Союз сельской молодежи», ТОО «GP group» и др.

С 2015 года занимал должность главного инспектора акима Северо-Казахстанской области.

С октября 2015 по октябрь 2016 года работал руководителем управления предпринимательства и туризма акимата Северо-Казахстанской области. С ноября 2016 года по апрель 2019 года трудился на должности заместителя акима города Петропавловск Северо-Казахстанской области.

Работал заместителем заведующего Отделом внутренней политики АП РК, государственным инспектором АП РК.

В октябре 2023 года назначен заместителем акима города Астана.