Е. Кожагапанов родился в 1968 году. В 1992 году окончил Карагандинский государственный университет по специальности "экономика". В 1999 году – Алматинский государственный университет по специальности "финансы". В 2006 году окончил Российскую таможенную академию Государственного таможенного комитета РФ по специальности "юриспруденция". В 1987-1989 годах проходил службу в рядах Вооруженных сил СССР.
С 1990 по 1994 год занимался предпринимательской деятельностью.
С 1994 по 2007 год работал в государственных органах и предприятиях.
C 2007 по 2013 год занимал должность заместителя акима г. Астаны.
С 2013 по 2016 год работал председателем Агентства по делам спорта и физической культуры РК, президентом Федерации футбола РК.
С 2016 по 2017 год занимал должность советника Премьер-министра РК.