Трудовую деятельность Самат Гилимов начал с должности слесаря Совхоза Косшагыл Гурьевской области.
В разные годы занимал руководящие должности как в производственной и государственной сферах, в том числе службу в органах налоговой полиции РК. Работал руководителем аппарата-заместителем директора филиала "Эмбамунайгаз" АО "Разведка Добыча "КазМунайГаз", заместителем акима Актюбинской области. По Атырауской области руководителем инспекции Комитета транспортного контроля Министерства транспорта и коммуникаций РК, начальником Межрайонной инспекции транспортного контроля "Каспий" и руководителем Комитета транспортного контроля, заместителем председателя Комитета транспорта Министерства по инвестициям и развитию Республики Казахстан.
До настоящего времени являлся председателем Комитета транспорта Министерства индустрии и инфраструктурного развития Республики Казахстан.